超算云
AI智算云
返回列表研究目的
研究的目的在于從這兩種狗牙花植物中提取分離出結構骨架新穎且生物 活性強的新生物堿，而在整個研究過程中，能否確定新生物堿的絕對構型是重點 也是難點。目前，手性光學性質的量子力學計算已迅速成為確定天然產物絕對構 型的最常用方法，其中，用含時密度泛函理論(TDDFT)計算電子圓二色性(ECD) 光譜是最常用的方法之一。
研究方法
研究人員首先通過 1D 和 2D NMR 確定了 flabelliformide-apparicine 型新骨架 二聚體生物堿的平面結構以及各手性中心的相對構型，然后，在超算云平臺的輔助下，選取該化合物的一種可能構型進行構象優化，并對其優勢構象進行量子化學 計算得到計算ECD圖譜。最后，研究人員比較計算 ECD 圖譜與實驗ECD圖譜 中的變化趨勢確定了該新化合物的絕對構型，并推測了該化合物的生源合成途徑。
平臺使用
課題組利用超算云，采用密度泛函理論(TDDFT)對分離得到的新生 物堿某一構型的優勢構象進行激發態計算，生成計算 ECD 圖譜。最后，通過比較各新生物堿的計算 ECD 圖譜與實驗 ECD 圖譜來確定其 絕對構型。在實驗過程中，計算量達到千核規模，計算時間從四個小時縮短到 兩個小時，性能提升了一倍。
